食、火药和其它补给品样样缺乏，长期航海后，水手因病减员严重。此外，法西两国的官兵还经常起内讧，擦枪走火事件不断发生。此时，拿破崙对贻误了进攻英国战机的维尔纳夫已极为不满，准备让海军上将罗西里来替换他。拿破崙对法国舰队的作用已不抱什么希望，只要求法国舰队从加的斯出发，在那不勒斯一带完成牵制性运动，然后回到土伦检修、休整。