虽然佩里本人得到了日本人的尊敬，但他没有，很可能也无法完全了解他的出现在日本人心中造成了多大的混乱。然而，他和其他任何人都能看到紧接而来的日本国内的实际动乱。日本事实上的统治者“将军”(天皇新封的“大名”——地区军阀——中最有势力者)为了国家安全的利益签署了条约。但日本的天皇是一个保守而仇外的人。他根本不相信蒸汽船能从大海的另一端把大炮运来；他不相信这种军舰有可能把一支不可战胜的武装力量带来反对日本。因此，他不愿批准这个条约。虽然他只是名义上的统治者，但他的批准是至关重要的，而且他还得到同他一样偏狭的“大名”们的支持。于是，内乱爆发了，并且逐渐演变成大规模的内战。