六月三十日，习仲勋还安排省委书记、省委纪委书记李坚真就落实干部政策问题，在省委四届一次常委扩大会议上作专题发言。李坚真在发言中强调，要坚持实事求是的原则，严格区分和正确处理两类不同性质的矛盾，凡属冤假错案的坚决平反，凡属应纠正的坚决纠正，错多少纠多少。会后，按照习仲勋的指示，省委批转了李坚真的发言，要求全省各地认真贯彻落实。
七月十一日，习仲勋再次主持召开省委常委会议，听取统战工作的汇报，专门就落实政策作出指示。他说，民族资产阶级这些人在“文化大革命”中受衝击最大，做统战工作的同志要知道这种情况，他们被查抄的财物、被挤占的私人房屋，要按党的政策办事，该退赔的就要退赔;对错划的右派分子，要坚决按照中央文件精神，全部摘掉右派分子帽子;民族工作，要认真解决海南、韶关等地的国营农林场与少数民族社的山林土地纠纷问题。他要求，把国家拨给少数民族地区的款项专款专用，说这样“能办许多事，几年就可以把少数民族地区的建设搞起来”。习仲勋重视政协工作，提出统战部要通过政协这个组织，做好联繫各方面群众和人士的工作。他要求，要把一些有代表性的老人和老干部安排到政协去工作，不要老说他们的缺点，要多看他们的成绩;对党外老知识分子，不要再提他们是“从旧社会过来的”，直接称“党外老的高级知识分子”。他要统战部门把民主党派成员的分布情况搞清楚，有针对性地开展工作。并指示做好宗教工作，按宪法办事，有信教的自由，也有宣传科学道理和无神论的自由。关于侨务工作，他要求统战部也要管侨务政策的落实。他还要求列席会议的省委组织部、省计委、省公安局、省财政局、省侨务办、广州市委统战部的负责人认真贯彻会议精神，协助落实好各项统战工作政策。
习仲勋注意抓了一些影响大的案件的平反昭雪。在他的督促下，庄辛辛冤案得以平反，受到了人民群众的讚誉。一九七六年四月初，北京发生了“天安门事件”，广州人民以各种方式悼念周恩来，拥护邓小平，反对“四人帮”，其中突出的一个是广州半导体材料厂的青年工人庄辛辛。他于四月七日向《人民日报》、《红旗》杂誌公开写信说：“支持邓小平!打倒张春桥!支持邓小平!打倒姚文元!支持邓小平!打倒江青!”“敬爱的周总理，永远活在我们革命人们的心中!”“我们要的是真正的马克思列宁主义!我们不要阉割的马克思主义!”庄辛辛因此遭到逮捕和批斗，按“反革命罪”被判处有期徒刑。一九七八年七月十四日，中共广州市委常委扩大会习议研究庄辛辛案件，决定为其彻底平反。习仲勋参加会议并讲话说：“‘文化大革命’时，庄辛辛还是个小孩子，他这样关心国家大事，我们比不比得上他?我就比不上他。像这样的人，在激烈的阶级斗争和路线斗争中，这样立场坚定，旗帜鲜明，是不简单的，是很值得我们学习的。”当天，中共广州市委在中山纪念堂召开五千人参加的大会，省委书记李坚真受习仲勋的委派出席大会，宣布为庄辛辛彻底平反，恢復名誉。广东省为庄辛辛案件公开平反，在全国处理同类案件中是较早的。
一九七八年底中共中央召开工作会议和中共十一届三中全会，对彭德怀、陶铸、杨尚昆等人的冤案平反，对薄一波等六十一人叛徒集团的冤案平反，对“二月逆流”、天安门事件等重大冤案平反，极大地推动了全国各地落实政策的工作，使广东彻底解决“文化大革命”中及其以前的冤假错案的决心更加坚定。
一九七九年一月，中共广东省委召开四届二次常委扩大会议，贯彻落实党的十一届三中全会精神。在会上，习仲勋对全省各项工作做出安排部署的同时，集中讲了平反冤假错案问题。他旗帜鲜明地否定了“文化大革命”中广东的“一·二二”夺权事件，“反击右倾翻案风”运动等，宣布因这些问题受到迫害、株连的人和事予以彻底平反。他还代表省委对广东历史上的重要案件和遗留问题表明态度。
习仲勋说，“文化大革命”中，黄永胜等人秉承江青一伙的旨意，在广东成立专门机构，“审理广东地下党”，揪“南方叛徒网”，目的就是要反对和否定周恩来。他郑重地宣布，因这些案件受迫害的同志都应当平反昭雪;抗战时期广东党组织是在周恩来为书记的南方局领导下从事革命斗争的，是我们党的一个重要组成部分，所谓“南方叛徒网”本身就是一个冤案，应该彻底平反;全国解放前活跃在广东各地的人民武装队伍，都是党所领导的革命武装，在革命斗争中起了重要作用，把广东人民武装称为“土匪部队”，完全是诬衊之词，必须彻底平反;海丰发生的反彭湃事件，矛头也是指向周恩来和叶剑英等老一辈无产阶级革命家的，现在这一冤案已得到平反昭雪，被颠倒了的党的历史要重新恢復过来，对在这一事件中疯狂进行阶级报復、残酷杀害彭湃烈士侄儿彭科的洪桂文和其他几个民愤极大的凶手，交专政机关依法严惩。【贺氏藏书·刘大海精校】
习仲勋还再次强调了处理反右派斗争和“四清”运动中遗留问题的政策。他说，对于一九五七年反右派斗争中存在的问题，中央已发文件，明确指出凡是属于搞错了的，必须改正。广东省应按