、器械、军资、珍宝堆积如山，牛马驴骡骆驼等十万余头。
司马曜下诏派殿中将军慰劳谢玄军队，加授谢玄前将军、假节，但谢玄坚决推辞不接受。朝廷赐其上百万钱，上千匹彩绸。
不久，谢安上奏朝廷，认为苻坚新近败丧，应乘有利时机，以谢玄为前锋都督，率冠军将军桓石虔直指涡、颍，经略旧都。
于是谢玄又率部进驻彭城，遣参军刘袭攻打苻坚的兖州刺史张崇于鄄城，赶走张崇，派刘牢之据守鄄城；再遣淮陵太守高素率三千人马出击广固，迫使苻坚的青州刺史苻朗投降归顺。
又进军讨伐冀州，遣龙骧将军刘牢之、济北太守丁匡据守碻磝，济阳太守郭满据守滑台，奋武将军颜雄渡过黄河建造营垒。
苻坚之子苻丕遣部将桑据进驻黎阳。谢玄命刘袭夜袭桑据，桑据逃走。
苻丕惶恐不安，向东晋请求合作，谢玄答应请求。
苻丕告饥，谢玄送给苻丕二千斛军粮。又遣晋陵太守滕恬之渡过黄河据守黎阳，三魏之地皆归降东晋。
兖州平定后，谢玄忧患水道险阻不通，运粮艰难，便采纳督护闻人奭的建议，筑土坝拦截吕梁之水，树立栅栏，合七埭为一支流，承接两岸的流水，以利于漕运，从此公私两便。又进军攻青州，所以将这一水利工程称为青州派。
东晋朝廷因兖、青、司、豫四州均已收复，便任命谢玄都督徐、兖、青、司、冀、幽、并七州军事。
谢玄上疏朝廷，认为刚平定河北之地，幽州冀州必须专门命人总督，司州遥远，应归豫州统管。朝廷论功封谢玄为康乐县公。
谢玄请求把他先前所封东兴侯的爵位赐予侄儿谢玩，朝廷许可，封谢玩为豫宁伯。
谢玄又遣宁远将军竂演讨伐占据魏郡的申凯，击败了申凯。
谢玄打算让豫州刺史朱序镇守梁国，自己坐镇彭城，北可以巩固河北之地，西可以援救洛阳，内可以捍卫朝廷。
但此时朝臣却议论认为征战已久，应当设置戍守边关，然后休兵养息，派谢玄回镇淮阴，朱序镇守寿阳。
而前秦帝国在淝水之战后，前秦元气大伤，先前被统一的鲜卑、羌等部族酋豪纷纷举兵反叛，建立割据政权。
先是慕容垂逃回前燕故地复国称王，慕容宗族的子弟慕容麟、慕容凤、慕容农、慕容隆等人跃马披甲，遍地狼烟；羌族的姚苌等人重新崛起；丁零人翟斌也起兵反叛，北方重新四分五裂。
苻坚困守长安，看见前燕贵族背信弃义，把慕容暐叫到面前大骂：“你们家族的兄弟子侄布列上将，当时虽称是灭国，其实我待你们如同归家一样，让你们享尽了荣华富贵。现在慕容垂、慕容冲、慕容泓各个称兵，你们家族真是人面兽心，枉我以国士对待你们。”
虽然如此，苻坚对鲜卑人仍不忍心诛杀，苻坚安抚慕容暐等人，待他们如从前一般。
长安城内，犹有一千多名鲜卑人在大宅子里住着，慕容暐、慕容肃等人时刻不闲，秘密招集族人准备埋伏人马袭杀苻坚，其间消息泄露，苻坚大惊连忙调查此事，最终谋反之事坐实，苻坚这才诛杀慕容暐父子及其宗族，城中鲜卑不论少长及妇~女全被杀光。
自此之后，灭人国者如果不忍心对亡国家族下绝杀令，劝谏者往往以苻坚为“柔仁”的首例，致使后代亡国之皇族少有保全者。
西燕多次被前秦窦冲、杨定、苻宏等人击败，西燕国主慕容冲也很畏惧杨定，但当初苻坚迁徙关东数十万徒何鲜卑进入关中，又从关中迁徙十五万户氐族人出镇外地，导致前秦在关中兵力不足，此时后秦皇帝姚苌亦分兵拦截前秦各路勤王部队，征西将军姚硕德率众与前秦河州刺史毛兴、秦州刺史王统于陇西对峙。
西燕在长安城外围城日久，城中乏粮，以至于出现人吃人的惨剧。苻坚倾尽最后家底，将自己的余粮分给他人，打仗的将军也分不到几片肉吃，塞进嘴里不敢咽下，回到家“吐肉以饴妻子”。
数月之间，烟尘四起，百姓死亡无数。
慕容冲率众登长安城，苻坚全身甲胄，亲自督战，飞矢满身，血流遍体。
最后，苻坚听信谶言“帝出五将久长得”的谶言，从长安出奔，留太子苻宏守城。
慕容冲纵兵大掠长安，死者不可胜计。有长安百姓千余户逃至东晋，东晋戍边将领竟诬陷难民为“游寇”，将男丁杀害，女子占为己有，生了孩子之后就赏给其他人接着生，在无法生育以后，就全部杀掉。
苻坚逃往五将山，羌族首领姚苌派兵包围了他，秦兵溃奔，身边只剩下十余个侍卫。苻坚此时帝王之度不改，坐而待之，召厨师进食。
姚苌大将吴忠驰马赶到，把苻坚捆起来送到新平，继而姚苌又派人向苻坚索要传国玉玺。
苻坚张目喝道：“小小羌胡竟敢逼迫明国天子，五胡的历数次序，没有你这个羌人的名字。玉玺已送到晋朝那里，你得不到的了！”
姚苌让苻坚禅让给他，苻坚大骂：“禅代，是圣贤的事，姚苌是叛贼，有什么资格做这事！”
苻坚自以平生都待姚苌不薄，甚至在淝水之战前将“龙骧将军”这个祖父曾受以及自己杀苻生夺位时有的将军号珍而重之的封予姚苌，现在姚苌反叛并逼迫他，于是屡次责骂姚苌以求死，姚苌生~性~好~色，苻坚为免姚苌凌辱两名女儿，于是忍痛先杀苻宝和苻锦。
而姚苌命人将苻坚绞死于新平佛寺内，时年四十八岁，张夫人及苻诜亦跟着自杀。
苻坚，这位一生以仁义宽厚著