衔孙传庭为副帅，参赞军务，并以其麾下秦兵为重要突击力量。
曹文诏、吴三桂、周遇吉同为先锋大将，各率精兵，为全军开路破阵。
而祖大弼则被委以巩固后方、保障粮道畅通的重任。
这套阵容，兼顾了辽东本地将领的地利人和、边军宿将的作战经验、以及新生代猛将的锐气。
西路军，蒙古方向：此路关键在于与蒙古骑兵的协同。以骁勇善战、且近年来在整顿京营中立功的孙应元为主将，悍勇异常的黄得功、年轻锐气的曹变蛟为副，统率大明抽调的精锐骑兵与步营，与科尔沁部台吉阿布奈所率的蒙古联军会师，自草原出击，威胁沈阳侧翼，并负责截击可能西窜的建奴残部。
南路军，水路、朝鲜方向：跨海作战，非水师不能为。
此路主帅毫无悬念，由熟悉海况、手握强大水师且与太子关系密切的郑芝龙担任。
他将率领庞大的大明水师舰队，搭载精锐陆营，联络朝鲜军队，自皮岛、朝鲜义州等地渡江，在辽东半岛南端登陆，牵制袭扰建奴后方，切断其可能的渡海逃遁之路，并与主力形成南北夹击之势。