异端审判庭的机秘议程有关联，至于这两个组织联手执行的隐秘任务到底是什么则只有它们各自的最高阶成员才知晓，而已经有许多异教徒因探求这些知识而招来惩罚，死于酷刑的煎熬之中。
扩张(EXPANSION)
战斗修士团（OrdersMilitant）日渐变为一个庞大强势的组织，塞巴斯蒂安雷神的继任者，教宗阿里克西斯（AlexisXXII）（铃铛语：22世……真够强的）颁布教令，把两个隐修院各自再一分为二。小隐修院被分为以多米尼卡（Dominica）为首任领袖的乌木圣杯修士团（theOrderofEbonChalice），和由希尔瓦娜（Silvana）领导的银色寿衣修士团（theOrderoftheArgentShroud）（铃铛语：在IA5里有提到）。圣隐修院被分为由凯瑟琳（Katherine）领导的烈火之心修士团（theOrderoftheFieryHeart），和由鸬鹚娘（Lucia）领导的勇气之心修士团（theOrderoftheValorousHeart）。（铃铛语：鸬鹚娘V5！）
直到第36个千年晚期，战斗修女已经成为了帝国国教在现世力量的代称，强力的推行教义，致力于其横跨银河的战争，并始终以下属武装的身份对异端审判庭提供支持。修士团则进一步扩张，在遍布帝国的主要世界里建立附属隐修会（subsidiaryconvents）。多米尼卡（Dominica），凯瑟琳（Katherine），希尔瓦娜（Silvana）和鸬鹚娘（Lucia），她们每人都在生前被宣为活圣人（LivingSaints））。（铃铛语：鸬鹚娘一如既往的V5！）他们的壮举即使在整个银河的传说之中亦堪称传奇，然而传奇很少有圆满的结局，多米尼卡（Dominica），接着是希尔瓦娜（Silvana）和鸬鹚娘（Lucia），都殉于嫉恨她们信仰和纯洁的恶徒之手（铃铛语：悲剧……天大的悲剧，鸬鹚娘，你永远活在我们心中！！！）。凯瑟琳（Katherine）被龌龊男们（Witch-cultOfMnestteus）谋杀，她的修士团为此更名为我们的殉教女士修士团（theOrderofOurMartyredLady），以表达她们深深的哀思。
在第38千年中期，教宗迪瑟斯VI再建立了两个修士团，来自圣隐修院的圣血玫瑰修士团（theOrderoftheBloodyRose），以及来自隐修会的神圣玫瑰修士团（theOrderoftheSacredRose）（铃铛语：灵魂风暴里的那帮修女就是神圣玫瑰……）。这些修女都是多米尼卡（Dominica）的另外两位战友米娜（Mina）和阿尔贝拉（Arabella）的敬仰者，虽然这些久逝的烈士从没领导过自己的修士团战斗，她们的名号依旧被修士团作为信仰的道标，圣血玫瑰追随于米娜，圣洁玫瑰尊奉着阿尔贝拉。
姐妹会与猎巫人(THESISTERHOODANDTHEWITCHHUNTERS)
追朔历史，修女会接手了众多任务，其中一些由于授意于隐秘的异端审判庭而永远不可能载入帝国的官方历史。圣徒阿斯比拉（Aspira，干脆叫阿司匹林算了），圣血玫瑰的第18大修女，领导她的姐妹们投入了对抗Denescura暴君（TyrantofDenescura）的虔信之战，以千人的队伍解放了上百世界（铃铛语：………………强力党？）。当高阶告解者（ArchConfessor）Cornelius发动虔信之战，使第二光环分裂派系煽动家们（DemagoguesoftheSecondHaloSchism）的炼狱之火在火刑柱上烧至二十米之高时，是神圣玫瑰修士团的战士从背后突破了异教徒在光芒神殿（PalaceofRadiance）的疯狂防御。当臭名昭著的告解者帕特苏斯（Petasus）在恰尔卡（Charak）指挥对变种人的屠（和谐）杀时，是克里斯玛（Chrisima）大修女团长（CanonessPreceptor）领导下的银寿衣修士团以火焰净化了街道上的基因变异污物。
虽然没有对之的完整记录存在，但普遍认为是我们的殉教女士修士团，奉异端审判庭的寻巫人（WitchFinder）Tannenburg之令，突击了圣加瑞特抄写室（SaintGarratScriptorum），把数百名尖声叫喊的总管庭书记员拖入位于惩戒纪念（NemesisTessera）的拷问室，并把抄写室付之一炬，为此，总管庭在地球上以最高权限的名义对这一屠戮行为递交了正式指控，然而当审判官Tannenburg出示了三百个装有样本的罐子后，此事便归于沉寂。每个样品罐中都装着一位书记员的断肢残骸，这一猝然的动作使在场的每一个人都心里凉了半截，所有人在无声的，深深的恐惧中盯着这些罐子，Tannenburg骇人听闻的证物带来的恐怖感深深的印在了内务部的深处。
信仰守护者(DEFENDERSOFTHEFAITH)
在第41千年